Quatre tests moléculaires HPV sont aujourd’hui validés par la Food and Drug administration (FDA) mais aucun ne l’est pour d’autres prélèvements que ceux recueillis par les frottis cervicovaginaux. Ce qui veut dire que, théoriquement, on ne peut pas les utiliser sur des prélèvements oropharyngés ou anaux même si les publications scientifiques en font état. Aujourd’hui la seule indication en France dans le dépistage du cancer du col est le frottis indécis, c’est-à-dire le frottis ASC-US.