Dans les maladies neurodégénératives comme Parkinson ou Alzheimer, l'activation de l'autophagie pourrait en théorie éliminer les protéines non conformes, comme la protéine Tau dans la maladie d'Alzheimer.

Certaines tentatives ont déjà eu lieu avec le resvératrol, un activateur de l'autophagie contenu dans la peau du raisin et dans le vin. Pour l'instant, peu de résultats concluants ont été publiés.