Les chercheurs ont démontré l’existence d’un dérèglement complet des systèmes cérébraux de modulation de la douleur chez les patients fibromyalgiques. Il serait dès lors possible d'agir sur cette pathologie par des techniques de neuro-modulation, telles que la stimulation magnétique transcrânienne. L’équipe de Didier Bouhassira, a pu montrer qu’en appliquant mensuellement cette thérapeutique aux patients atteints de fibromyalgie, on obtenait chez 30 à 40 % d'entre eux des effets qui se maintenaient pendant plusieurs mois sur la douleur et la qualité de vie (fatigue, troubles du sommeil, etc.). Cette prise en charge est maintenant utilisée en routine au centre d'évaluation de la douleur de l’hôpital Ambroise-Paré et dans d’autres centres.
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